-Libros - Documentos de trabajo - "GESTIÓN RESPONSABLE DEL AGUA: Experiencias de implementación del Estándar AWS en La Libertad e Ica" (en coautoría con: Daniel De La Torre Ugarte), Documento elaborado para el Programa SECOMPETITIVO de la Cooperación Suiza – SECO., Noviembre 2017. - “Conectividad para el desarrollo agrícola. Una mirada de largo plazo” (en coautoría con: Yohnny Campana y Elmer Guerrero), Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura, Lima, 2017. ISBN: 978-92-5-309616-9. [Disponible en: http://www.fao.org/3/a-i6762s.pdf] - “Plan Nacional de Infraestructura 2016 – 2025”, (en coautoría con: José Luis Bonifaz, Roberto Urrunaga y César Urquizo), Asociación para el Fomento de la Infraestructura Nacional, Noviembre 2015. - “Las Concesiones de Infraestructura en Perú: Diagnostico y Retos”, (en coautoría con: Roberto Urrunaga y José Luis Bonifaz), Cámara de Comercio de Lima, Noviembre 2015. - Cálculo de los beneficios sociales de la electrificación rural en el Perú” (con Roberto Urrunaga, José Luis Bonifaz, Gisella Aragón y Óscar Jara). Documento de Trabajo 91, Lima: Universidad del Pacífico, 2013.
Publicaciones electrónicas - Aguirre, J. (2023) "Plataformas digitales y “takes rates” [Disponible en: https://centrocompetencia.com/plataformas-digitales-takes-rates/] - Aguirre, J. (2023) "Las fusiones sashimi y los mercados del futuro". [Disponible en: https://centrocompetencia.com/las-fusiones-sashimi-y-los-mercados-del-futuro/] - Ramírez, Y., Jieza, A., Ramos, A. y Aguirre, J. (2023). “El machine learning en el modelo de detección de cárteles en licitación pública de Bajari y Summers”. [Disponible en: https://centrocompetencia.com/el-machine-learning-en-el-modelo-de-deteccion-de-carteles-en-licitacion-publica-de-bajari-y-summers/] - Aguirre, J. (2023) “¿Independencia de jure o de facto? Un análisis del INDECOPI a la luz de las investigaciones de Ty-Cheng Ma”. [Disponible en: https://centrocompetencia.com/independencia-de-jure-o-de-facto-un-analisis-indecopi/] - Aguirre, J. (2023). "Especial ABA 2023: Una guía económica para la libre competencia". Centro de Competencia - Perú. [Disponible en: https://centrocompetencia.com/especial-aba-2023-una-guia-economica-para-la-libre-competencia/] - Aguirre, J. (2022). "OCDE: Herramientas de data screening para Investigaciones sobre Competencia". Centro de Competencia - Perú. [Disponible en: https://centrocompetencia.com/ocde-herramientas-data-screening-investigaciones/] - Aguirre, J., De La Torre Ugarte y Bazo, J. (2022). "Inversión pública en la prevención y reducción de los impactos de los desastres de origen natural", Agenda 2022. Contribuciones para una mejor gestión pública regional y local. [Disponible en: https://agenda2022.pe/papers/inversion-publica-en-la-prevencion-y-reduccion-de-los-impactos-de-los-desastres-de-origen-natural/] - Aguirre, J., Bonifaz, J.L., Urrunaga R., y Taquiri, F. (2021). “Contribución Económica de las Industrias Creativas en base a los Derechos de Autor en el Perú”, Estudio Económico, Instituto Nacional de Defensa de la Competencia y de la Protección de la Propiedad Intelectual (INDECOPI), Secretaría de Estado para Asuntos Económicos (SECO) y Escuela de Gestión Pública de la Universidad del Pacífico. [Disponible en: https://www.indecopi.gob.pe/documents/1902049/7676874/Estudio+econonimo.pdf/cb112593-cfb1-e324-6265-f84cc39bbc4f] - Bonifaz, J.L., Urrunaga, R., Aguirre, J., y Quequezana, P. (2020). "Brechas de infraestructuras en la región andina", Documento para Discusión Nº IDB-DP-00807, Departamento de Países del Grupo Andino (CAN), Banco Interamericano de Desarrollo (BID), Octubre http://dx.doi.org/10.18235/0002716 - Bonifaz, J.L., Urrunaga, R., Aguirre, J., y Quequezana, P. (2020). "Brecha de infraestructura en el Perú: estimación de la brecha de infraestructura de largo plazo 2019 - 2038", `[Coordinadores técnicos: Pastor, C. y Brichetti, J.P.], Monografía del Banco Interamericano de Desarrollo (BID; 838), Septiembre. http://dx.doi.org/10.18235/0002641 - “Ganancias de electricidad en pueblos rurales”, Centro de Investigación de la Universidad del Pacífico, Setiembre, 2018. - "Infraestructura pública: la planificación subnacional sí importa", (en coautoría con Roberto Urrunaga), Agenda 2018. Propuestas para mejorar la descentralización. Temas urgentes para el desarrollo regional y local del Perú [Disponible en: http://agenda2018.pe/papers/infraestructura-publica/], Agosto - Setiembre 2018. -“Políticas públicas, servicios ecosistémicos y desarrollo regional en la Amazonía de Colombia, Ecuador y Perú”, (en coautoría con Rosario Gómez), Iniciativa para la Conservación en la Amazonía Andina – ICAA, Marzo 2016. [Disponible en: http://www.amazonia-andina.org/sites/default/files/politicas_publicas_y_servicios_ecosistemicos.pdf] -“Valoración económica de servicios ecosistémicos: Estudios de caso en Colombia, Ecuador y Perú”, (en coautoría con Rosario Gómez), Iniciativa para la Conservación en la Amazonía Andina – ICAA, Marzo, 2016. [Disponible en: http://www.amazonia-andina.org/sites/default/files/politicas_publicas_y_servicios_ecosistemicos.pdf]